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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  28 lines
  1. **********************************************
  2. * 6-phosphogluconate dehydrogenase signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. 6-phosphogluconate dehydrogenase (EC 1.1.1.44) (6PGD) catalyzes the third step
  6. in  the  hexose   monophosphate   shunt,   the  decarboxylating  reduction  of
  7. 6-phosphogluconate in to ribulose 5-phosphate.
  8.  
  9. Prokaryotic and  eukaryotic 6PGD  are  proteins of about 470 amino acids whose
  10. sequence are highly conserved [1].  As a  signature pattern we have selected a
  11. region which has been shown [2],  from  studies  of  the  sheep  6PGD tertiary
  12. structure, to be involved in the binding of 6-phosphogluconate.
  13.  
  14. -Consensus pattern: [LIVM]-x-D-x(2)-[GA]-[NQS]-K-G-T-G-x-W
  15. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  16. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  17.  
  18. -Expert(s) to contact by email: Reizer J.
  19.                                 jreizer@ucsd.edu
  20.  
  21. -Last update: October 1993 / Pattern and text revised.
  22.  
  23. [ 1] Reizer A., Deutscher J., Saier M.H. Jr., Reizer J.
  24.      Mol. Microbiol. 5:1081-1089(1991).
  25. [ 2] Adams M.J., Archibald I.G., Bugg C.E., Carne A., Gover S.,
  26.      Helliwell J.R., Pickersgill R.W., White S.W.
  27.      EMBO J. 2:1009-1014(1983).
  28.